En mai 2026, l'Afrique fait face à des épidémies simultanées d'Ebola et de hantavirus, ce qui relance les appels à la souveraineté sanitaire. Selon l'Organisation mondiale de la santé (OMS), des cas d'Ebola ont été signalés en Ouganda et en République démocratique du Congo, tandis que le hantavirus est apparu en Afrique australe, notamment en Afrique du Sud et en Namibie. Ces épidémies surviennent alors que le soutien des donateurs internationaux aux programmes de santé en Afrique diminue, le Plan d'urgence du président des États-Unis pour la lutte contre le sida (PEPFAR) étant confronté à des réductions budgétaires et le Fonds mondial signalant un déficit de financement.
En réponse, les États membres de l'Union africaine ont accéléré leurs efforts pour établir une capacité locale de fabrication de vaccins. Le Centre africain de contrôle et de prévention des maladies (Africa CDC) a annoncé en avril 2026 qu'il vise à produire 60 % des besoins en vaccins du continent d'ici 2040, contre moins de 1 % actuellement. Plusieurs pays, dont le Rwanda, le Sénégal et l'Afrique du Sud, ont déjà commencé à construire des installations de production de vaccins avec le soutien de la Banque mondiale et de l'Union européenne.
Le Dr John Nkengasong, directeur de l'Africa CDC, a déclaré lors d'un point de presse le 10 mai 2026 : 'L'ère où nous comptions uniquement sur les donateurs externes pour notre sécurité sanitaire doit prendre fin. Nous voyons les conséquences de l'iniquité vaccinale, et nous devons construire notre propre capacité à répondre aux épidémies comme Ebola et le hantavirus.' L'épidémie de hantavirus, qui a causé au moins 12 décès en Afrique du Sud depuis mars 2026, a mis en évidence le besoin de tests de diagnostic rapides et de traitements qui ne sont pas encore largement disponibles dans la région.
Cependant, des défis subsistent. L'Africa CDC estime que 10 milliards de dollars sont nécessaires au cours des cinq prochaines années pour atteindre l'autosuffisance vaccinale. Pendant ce temps, l'OMS a averti que l'épidémie d'Ebola en Ouganda, qui a commencé en février 2026, a infecté 45 personnes et causé 18 décès au 15 mai 2026. L'épidémie de hantavirus, qui se propage par les excréments de rongeurs, a été liée à un mauvais assainissement dans les établissements informels, selon l'Institut national des maladies transmissibles d'Afrique du Sud.
Malgré ces obstacles, les dirigeants africains considèrent les crises actuelles comme une opportunité de construire des systèmes de santé résilients. Le Nouvel ordre de santé publique de l'Union africaine, adopté en 2025, donne la priorité à la production locale de médicaments et de vaccins, ainsi qu'au renforcement de la surveillance des maladies. Alors que le soutien des donateurs diminue, la poussée pour la souveraineté sanitaire gagne du momentum à travers le continent.
